直到有一天，战争打响了。

谁都无法意料到地，敌人以迅猛之势很快击溃了祖国在西部的边境，狰狞着爪牙向着中部侵犯。她的夫人与两个女儿因为对战争的恐惧而离开雪谷回到了东部的首都，然而林海民没有当懦妇。

雪谷的天文台被敌人误认为雷达，因而在一次空袭中被敌方空军炸毁。许多为了挽救数据而冲进火海的天文学家也在第二次轰炸中遇难。林海民因此离开了雪谷，却没有去安逸的后方，而是加入了丰洲共和国的原子|弹计划——当年在天体物理与原子物理之间她选择了前者，而现在是重新选择的时候了。

为了保护祖国和人民，林海民和其余的几十个物理学家奋战在极北苔原上的研究所中，四年的时间她们终于已经快要摸到成功的大门。但这胜利的曙光却又被残忍地截断，由于叛徒的泄密，原子|弹计划被敌方发现，交火中研究所的驻军被消灭殆尽，而物理学家全都被敌军抓走。

不知是她的幸运还是不幸，研究所被攻陷时，林海民因为正在操作电子管计算机而躲藏在了那纷杂的数据线里，并没有被第一批搜查的敌军发现。但那之后第二批来搬运计算机的敌军便无可避免地发现了她。

因为其他丰洲共和